El segundo nivel pone más énfasis sobre el cuerpo energético y las causas de las situaciones en contraste con el enfoque en el cuerpo físico del primer nivel.
El segundo grado de Reiki incluye una iniciación, la introducción y explicación de tres símbolos y prácticas. El alumno recibe tres de los símbolos para la sanación que fueron dados al Dr. Usui después de su meditación y ayuno en el Monte KuriYama. Con la iniciación a Segundo Nivel, se aumenta el canal de la energía Reiki y el uso de los símbolos permite tener acceso a niveles más altos de la energía Reiki. Se conecta a una fuerza utilizada desde hace miles de años por maestros sanadores, uniéndose a su energía.